More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4414 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 397 aa  814    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  48.96 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  47.94 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  46.04 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  43.94 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  43.96 
 
 		 393 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.4 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  42.53 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  41.77 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  42.57 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.18 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.52 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.63 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 445 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  25.72 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 457 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.56 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.69 
 
 		 745 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  26.34 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  24.44 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  25.9 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  20.95 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.57 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  26.92 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 768 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.06 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.36 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  23.21 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.27 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.53 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  26.36 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.29 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 761 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>