More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0925 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 761 aa  1542    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  48.37 
 
 		 774 aa  706    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 765 aa  719    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  59.25 
 
 		 759 aa  865    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  45.41 
 
 		 763 aa  656    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  70.18 
 
 		 789 aa  1075    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  48.04 
 
 		 790 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  50.48 
 
 		 767 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  43.5 
 
 		 780 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  44.97 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  37.63 
 
 		 797 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 		 759 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  39.18 
 
 		 747 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 774 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 762 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 756 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 386 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  40.36 
 
 		 391 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 		 411 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  37.96 
 
 		 391 aa  295  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 		 397 aa  291  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 		 395 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  39.63 
 
 		 405 aa  283  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  35.12 
 
 		 390 aa  260  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 399 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 416 aa  207  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  35.47 
 
 		 353 aa  207  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 371 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  30.41 
 
 		 349 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  35.7 
 
 		 399 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 393 aa  201  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 		 388 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  33.43 
 
 		 337 aa  194  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 414 aa  194  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 392 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  33.82 
 
 		 364 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  30.36 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 393 aa  174  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 393 aa  173  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 393 aa  173  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  34.49 
 
 		 371 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  34.08 
 
 		 404 aa  154  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  33.72 
 
 		 340 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  33.04 
 
 		 348 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  33.24 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  35.33 
 
 		 338 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  30.53 
 
 		 339 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  34.87 
 
 		 351 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  33.72 
 
 		 367 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 375 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 388 aa  92  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  24.15 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 396 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  21.41 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 348 aa  77  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 438 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 364 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 1233 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.69 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  25 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.29 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.39 
 
 		 416 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  23.82 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  31.39 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  24.08 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 770 aa  70.5  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  25 
 
 		 1635 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.44 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>