More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5324 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  47.16 
 
 		 790 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  100 
 
 		 759 aa  1571    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  59.25 
 
 		 761 aa  836    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  49.39 
 
 		 774 aa  719    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  57.14 
 
 		 789 aa  869    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  48.18 
 
 		 765 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  42.21 
 
 		 763 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  44.86 
 
 		 767 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  41.5 
 
 		 780 aa  584  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  42 
 
 		 823 aa  555  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 		 759 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 		 747 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  35.74 
 
 		 797 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 774 aa  360  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 762 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 756 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 		 386 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  39.19 
 
 		 391 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 		 411 aa  299  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  37.9 
 
 		 391 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 		 397 aa  270  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 405 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  35.48 
 
 		 390 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 395 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 371 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  34.77 
 
 		 353 aa  219  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  37.32 
 
 		 337 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 399 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 		 393 aa  213  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  33.63 
 
 		 349 aa  210  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 		 399 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  33.93 
 
 		 360 aa  208  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 392 aa  204  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 388 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 416 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 414 aa  200  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 378 aa  197  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 		 405 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  34.73 
 
 		 364 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 393 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 393 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  33.82 
 
 		 371 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 393 aa  167  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  35.95 
 
 		 338 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  37.76 
 
 		 340 aa  158  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  33.03 
 
 		 339 aa  158  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  34.55 
 
 		 348 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  32.66 
 
 		 378 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  33.24 
 
 		 404 aa  153  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  36.84 
 
 		 351 aa  141  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  34.72 
 
 		 340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  32.26 
 
 		 367 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  27.48 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 384 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 		 392 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.92 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.48 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  21.83 
 
 		 392 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 415 aa  67.4  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  23.3 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  29.73 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  29.73 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.01 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 351 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 356 aa  62  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 376 aa  62  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  23 
 
 		 395 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 364 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 379 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 344 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  21.43 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.99 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>