More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7536 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  63.51 
 
 
774 aa  912    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
762 aa  1507    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
774 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  36.33 
 
 
763 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
790 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
747 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
789 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
780 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
759 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  34.42 
 
 
759 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  30.76 
 
 
797 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
761 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
765 aa  361  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  37.75 
 
 
767 aa  360  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
823 aa  357  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  47.94 
 
 
416 aa  333  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
756 aa  312  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  51.28 
 
 
348 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
386 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
411 aa  254  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  36.17 
 
 
390 aa  253  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
391 aa  241  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 
391 aa  230  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
395 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
405 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
397 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
399 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
371 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
414 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
392 aa  173  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
399 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  33.51 
 
 
360 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
405 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  30.14 
 
 
349 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
388 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
378 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  29.83 
 
 
337 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  30.45 
 
 
353 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
393 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
393 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
393 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  29.83 
 
 
364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
340 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  35.4 
 
 
338 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  33.24 
 
 
340 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  29.24 
 
 
339 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  31.86 
 
 
378 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  30.08 
 
 
404 aa  101  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  32.86 
 
 
367 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  33.03 
 
 
351 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
1233 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
394 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.97 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
376 aa  67.4  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
378 aa  64.7  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.39 
 
 
372 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
380 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
373 aa  62  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
398 aa  61.6  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
386 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
375 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
428 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
405 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  16.15 
 
 
1232 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
350 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
374 aa  58.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
420 aa  58.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
370 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
411 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  41.79 
 
 
718 aa  57.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
375 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
422 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
401 aa  57.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
396 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
396 aa  57.4  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
377 aa  57.4  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
381 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
399 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 
387 aa  57.4  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
388 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.24 
 
 
360 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
384 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
394 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  29.71 
 
 
392 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
355 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
379 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
406 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
378 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
535 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  25.52 
 
 
390 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
394 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
358 aa  55.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
394 aa  55.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
356 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>