More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5607 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
428 aa  843    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.24 
 
 
371 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
411 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
426 aa  94  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.78 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.54 
 
 
775 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  29.94 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  25.24 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.42 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.44 
 
 
404 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
404 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  32.06 
 
 
398 aa  88.2  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
440 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
453 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
672 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
395 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.76 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  34.72 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  29.09 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  31.49 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.39 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0297  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
370 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.46 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
391 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
396 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.03 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  28.93 
 
 
859 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  30.38 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.09 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.61 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
860 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>