More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2890 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 409 aa  828    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  77.37 
 
 		 383 aa  567  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  66.06 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  63.8 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  63.54 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  62.56 
 
 		 434 aa  494  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  58.21 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  45.92 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  48.96 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  46.82 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  46.67 
 
 		 405 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  48.15 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.12 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.85 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.49 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  27.1 
 
 		 569 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 401 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.82 
 
 		 557 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.41 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  32.8 
 
 		 601 aa  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 768 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 904 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.73 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28.61 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.24 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.5 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.22 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.13 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  27.41 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.09 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.01 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  25.59 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>