More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0756 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 445 aa  905    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  58.41 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  56.02 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  54.82 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  53.81 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  47.38 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  47.63 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  42.69 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  21.79 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  30.45 
 
 		 723 aa  93.6  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 859 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  27.13 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  19.6 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.69 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.36 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  32.54 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 517 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.58 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.57 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  28.85 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.87 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.13 
 
 		 416 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 378 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.44 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.49 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  23.41 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0201  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00670088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  23.9 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.17 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 904 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  20.94 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>