60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8511 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
418 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
445 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 
419 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
417 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
458 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
481 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  36.75 
 
 
1188 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
575 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
904 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
391 aa  53.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
404 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  27.61 
 
 
569 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
464 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  36.05 
 
 
601 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.04 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  29.73 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  27.67 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  20.27 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  31.46 
 
 
557 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.69 
 
 
378 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  29.35 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>