More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3642 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  82.56 
 
 		 409 aa  672    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 411 aa  820    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  50.88 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  41.93 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  46.04 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5063  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  46.5 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  44.59 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.84 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  44.3 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  42.47 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 		 377 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  42.47 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  30.81 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  43.67 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  40.46 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.38 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  40.27 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  40.99 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  44 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  39.84 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  41.41 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  38.93 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  39.72 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  35.48 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  41.57 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  37.7 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  35.21 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  40.13 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.98 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  33.13 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  40.13 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  36.09 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  48.28 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  39.37 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 		 750 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 871 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  37.93 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  38.06 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  28.16 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.84 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>