More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2695 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 378 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  84.8 
 
 		 389 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  81.65 
 
 		 380 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  73.81 
 
 		 377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  72.27 
 
 		 377 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  77.57 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  72.8 
 
 		 377 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  48.4 
 
 		 468 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  48.11 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  45.82 
 
 		 419 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  45.82 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  46.36 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  41.47 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  42.24 
 
 		 375 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  40.53 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  38.62 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  39.46 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  29.35 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.58 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.58 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  22.37 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.58 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.58 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 		 750 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.58 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.11 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.11 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 739 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  23.57 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 425 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 304 aa  86.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 390 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.26 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.35 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  39.84 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  36.91 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.93 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  24.23 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  20.68 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  25.94 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  40.14 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  29.3 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 822 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  20.59 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  25.21 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.74 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>