68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3508 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
379 aa  772    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  41.72 
 
 
416 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  40.68 
 
 
820 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0556  hypothetical protein  27.47 
 
 
446 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
445 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4344  hypothetical protein  25.54 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  28.52 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  27.27 
 
 
464 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1137  hypothetical protein  26.35 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
517 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  30.57 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.91 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  28.57 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  27.37 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  22.18 
 
 
434 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  20.63 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  22.22 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.3 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
442 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  29.36 
 
 
430 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1526  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3711  hypothetical protein  32.5 
 
 
704 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
566 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
457 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
409 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
441 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  26.85 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  25.74 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  25.69 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  27.78 
 
 
475 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
1275 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.94 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.44 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
425 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
429 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
402 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4584  hypothetical protein  28.32 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
386 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
405 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
353 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
396 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
412 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>