More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0062 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
353 aa  695    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  42.42 
 
 
384 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  39.22 
 
 
358 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
370 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  24.06 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  27.72 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  27.72 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
387 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  26.73 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  27.72 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  26.73 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  30.46 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  33.54 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  28.98 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40.74 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  29.85 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  32.39 
 
 
486 aa  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.53 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.3 
 
 
935 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  37.32 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  37.4 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
364 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  37.4 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  37.4 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
904 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
353 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  40.79 
 
 
424 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  31.9 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 
412 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.99 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
401 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
500 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.99 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  34.31 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
410 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
377 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 
421 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
400 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  34.48 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
422 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
422 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  33.58 
 
 
392 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
458 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  46.43 
 
 
447 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 
408 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  31.95 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  34.4 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0376  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635949  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4807  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.89 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>