65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4432 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  61.06 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  60.19 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  61.27 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  34.99 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  28.95 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  31.91 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  30.77 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  27.07 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  32.67 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  31.7 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  30.02 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  29.27 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  27.18 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  29.23 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  21.5 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.91 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.91 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.52 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  26.6 
 
 		 522 aa  93.6  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  26.29 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  27.09 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  22.96 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  23.19 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  27.72 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  24.56 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  21.96 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23.01 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  29.09 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  23.08 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  22.1 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  29.17 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 476 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  25.06 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  31.15 
 
 		 820 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  23.21 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  28.63 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  27.2 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  25.11 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 378 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>