37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0684 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  889    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  49.87 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  44.39 
 
 		 416 aa  355  8.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  29.3 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.5 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.97 
 
 		 567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.97 
 
 		 567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  22.58 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  29.57 
 
 		 388 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  27.45 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  27.88 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  25.38 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  27.09 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  28.82 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.38 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  22.66 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  23.65 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  24.5 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  24.3 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  26.09 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  26.38 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  24.4 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  28.09 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  26.46 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  22.75 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  24.47 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  20.39 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  23.5 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  23.42 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  21.53 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  25.83 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2429  hypothetical protein  24.44 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>