43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0623 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  820    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  42.4 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  38.14 
 
 
430 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  36.92 
 
 
423 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  30.98 
 
 
441 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  28.92 
 
 
452 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  27.07 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  31.8 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  29.85 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  30.03 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
427 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  28.23 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.67 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
429 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.59 
 
 
454 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
424 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  28.83 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  25.68 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  24.48 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  24.25 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  27.43 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  24.81 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  28.9 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
567 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
567 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  24.3 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  22.62 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  25.19 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  25.19 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.09 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  23.88 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  22.33 
 
 
431 aa  59.7  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
357 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.71 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  25 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>