59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1943 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
424 aa  864    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  56.84 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  52.8 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
443 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
415 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
567 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
567 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  26.36 
 
 
442 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  28.93 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  26.5 
 
 
430 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  25.62 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
429 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  24.1 
 
 
430 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  23.77 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  25.5 
 
 
416 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  27.78 
 
 
423 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  26.99 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  24.66 
 
 
441 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  22.55 
 
 
464 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  23.16 
 
 
429 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  23.45 
 
 
452 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  25.5 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  21.76 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  22.96 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.99 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  23.78 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  22.89 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  22.98 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  25.07 
 
 
463 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  21.06 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  24.21 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  21.52 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  21.08 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  24.64 
 
 
428 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  24.13 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  21.65 
 
 
443 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  22.47 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  21.68 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  18.21 
 
 
412 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  22.34 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  22.72 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  22.74 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.66 
 
 
376 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  21.16 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  29.47 
 
 
820 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  30.21 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  25.76 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>