59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4581 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 416 aa  827    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  41.72 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2739  hypothetical protein  38.19 
 
 		 820 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  31.43 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  30.1 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  31.58 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  30 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0556  hypothetical protein  24.33 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  30.45 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3711  hypothetical protein  28.07 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  29.07 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1137  hypothetical protein  27.6 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  23.25 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4584  hypothetical protein  34.69 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  28.13 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.1 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  41.77 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4344  hypothetical protein  23.56 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1493  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 447 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  21.11 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  26 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.26 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  25.26 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 396 aa  46.6  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  32.94 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  42.19 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  42.19 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 810 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  27.14 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.41 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0792  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.416249  hitchhiker  0.00203694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 412 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>