44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0477 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 375 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.84 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.7 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  27.1 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  32.95 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  28.26 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  23.36 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.14 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  21.48 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  21.64 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  28.94 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  28.64 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  28.63 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  20.45 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0509  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.885399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  21.3 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  26.37 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  18.51 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  23.44 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  30.39 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.16 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  23.2 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  26.19 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.13 
 
 		 567 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  18.67 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.13 
 
 		 567 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  20.74 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  19.78 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  22.73 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  20.59 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 475 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>