36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2251 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  688    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  30.26 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  29.31 
 
 		 440 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  26.33 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  25.97 
 
 		 454 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  27.85 
 
 		 405 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  25.96 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  26.95 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.89 
 
 		 409 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  23.48 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  22.41 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  24.1 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  22.83 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  20.42 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  23.71 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 443 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  21.16 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.64 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  23.08 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  21.72 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  23.62 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  22.81 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  38.33 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.51 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  18.79 
 
 		 567 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  18.79 
 
 		 567 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  22.4 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  23.72 
 
 		 603 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  22.78 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.82 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  21.15 
 
 		 441 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.1 
 
 		 388 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>