111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0572 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
443 aa  880    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  33.26 
 
 
427 aa  273  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
424 aa  255  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  31.18 
 
 
431 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
429 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  35.17 
 
 
429 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  29.55 
 
 
415 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  32.66 
 
 
442 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.77 
 
 
567 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  27.77 
 
 
567 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  35.23 
 
 
464 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  32.75 
 
 
454 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  29.56 
 
 
522 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  33.33 
 
 
452 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  29.48 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  31.86 
 
 
416 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  34.99 
 
 
405 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  30.12 
 
 
419 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  30.99 
 
 
437 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  29.16 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  28.13 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  24.27 
 
 
423 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  28.23 
 
 
441 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  26.19 
 
 
433 aa  96.7  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  27.52 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
402 aa  86.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  22.74 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
412 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.88 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  25.3 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  23.46 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  18.79 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  19.57 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  20.83 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  22.22 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  28.36 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  24.39 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
416 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  23.38 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
517 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  19.57 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  21.29 
 
 
463 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
415 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  22.6 
 
 
475 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  20.88 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  21.95 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.07 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  19.08 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
411 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
427 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  23.74 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  24.3 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
423 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  23.02 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.55 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  20.59 
 
 
375 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  21.14 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  23.89 
 
 
451 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
457 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  25.54 
 
 
364 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  24.44 
 
 
723 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  24.75 
 
 
378 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
519 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  32.92 
 
 
416 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  26.59 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.14 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
363 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  24.83 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2429  hypothetical protein  22.94 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>