26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3904 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  31.05 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  30.34 
 
 
451 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  23.21 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  23.43 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  22.41 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  22.26 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  22.25 
 
 
454 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.75 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  21.04 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  21.79 
 
 
443 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
404 aa  50.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  20.85 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  21.55 
 
 
442 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  23.21 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  20.1 
 
 
522 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  21.47 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
443 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.59 
 
 
428 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  23.13 
 
 
428 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.32 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.32 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  25.22 
 
 
490 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>