36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3132 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  962    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.11 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  28.6 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  20.95 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  27.94 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  24.52 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  20.85 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.18 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.81 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.81 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  24.89 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  27.82 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  27.05 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  24.95 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  24.69 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  23.26 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  27.13 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  28.4 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  23.44 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  25.3 
 
 		 333 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  26.14 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  25.6 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  34.81 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  25.37 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2429  hypothetical protein  22.22 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  20.87 
 
 		 463 aa  43.9  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  25.22 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 380 aa  43.5  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>