69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3326 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  852    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  43 
 
 
419 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  44.39 
 
 
437 aa  345  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
429 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
443 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  25.96 
 
 
567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  25.96 
 
 
567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  30.92 
 
 
454 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  28.34 
 
 
415 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  27.61 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  26.65 
 
 
430 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
424 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  29.27 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  23.53 
 
 
431 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  27.44 
 
 
388 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  26.61 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  25.37 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  24.44 
 
 
464 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  27.03 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  23.99 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0884  hypothetical protein  25 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  29.74 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  21.98 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
522 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  21.99 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  24.73 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  22.62 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.55 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  23.79 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  21.48 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  23.48 
 
 
333 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  21.19 
 
 
428 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  20.86 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2235  hypothetical protein  24.28 
 
 
426 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.54794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  20.06 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  24.19 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
517 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2429  hypothetical protein  22.56 
 
 
444 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  21.88 
 
 
370 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.23 
 
 
409 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  26.01 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  25.75 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
441 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  22.69 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  24.32 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  25.95 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  22.14 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  21.08 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  18.75 
 
 
463 aa  43.1  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 
413 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
409 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
412 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>