20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2757 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  31.05 
 
 
403 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2428  hypothetical protein  32.88 
 
 
451 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  19.06 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  23.79 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  24.78 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.58 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  22.7 
 
 
419 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  22.6 
 
 
522 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  30.3 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  18.28 
 
 
567 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  18.28 
 
 
567 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  24.35 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  29.17 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  22.26 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  23.44 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  22.05 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  22.61 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
413 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>