60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3878 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
522 aa  1055    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
429 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
443 aa  163  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
415 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  29.61 
 
 
454 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
424 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  26.36 
 
 
464 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  24.21 
 
 
431 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  24.17 
 
 
567 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  24.17 
 
 
567 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  26.6 
 
 
429 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  25.68 
 
 
430 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  24.21 
 
 
442 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  22.96 
 
 
433 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  24.64 
 
 
452 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  25.28 
 
 
405 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  26.15 
 
 
441 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  23.91 
 
 
430 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  27.43 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  24.72 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  25.41 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  23.95 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3132  hypothetical protein  24.68 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.290688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  25.17 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  19.46 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  22.17 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  23.63 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2071  hypothetical protein  20.64 
 
 
463 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113923  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  21.71 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
416 aa  62  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  19.89 
 
 
428 aa  60.8  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
517 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  22.2 
 
 
451 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
408 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  19.36 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  22.53 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
411 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  21.46 
 
 
402 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  22.78 
 
 
333 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2302  hypothetical protein  18.33 
 
 
399 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000101435  decreased coverage  0.00084282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  21.53 
 
 
403 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  21.75 
 
 
412 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
416 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0174  hypothetical protein  22.13 
 
 
444 aa  48.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000353751  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  18.48 
 
 
375 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
405 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 
390 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 
413 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
405 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
400 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
419 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
373 aa  43.5  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>