36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1838 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  98.13 
 
 		 428 aa  837    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  855    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  23.42 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.22 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  22.15 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  24.63 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.47 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  20.74 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  22.78 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  22.1 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  22.49 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  19.85 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  25.19 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  22.51 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  22.52 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  24.07 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  20.86 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.4 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  22.4 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  19.52 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  20.82 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  19.57 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  23.62 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  23.24 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  25.57 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2757  hypothetical protein  22.05 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0186893  normal  0.238048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  20.81 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3904  hypothetical protein  23.59 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  20.69 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  22.92 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  22.12 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>