22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0268 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  908    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  76.99 
 
 		 443 aa  716    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2251  hypothetical protein  29.31 
 
 		 333 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.448728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  26.38 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  23.06 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  21.06 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  21.32 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.58 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  25.86 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  24.51 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.25 
 
 		 567 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  21.25 
 
 		 567 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  20.05 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  20.57 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1958  hypothetical protein  23.97 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.441917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  23.59 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  18.85 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  22.14 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  22.71 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  22.14 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>