More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7642 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
516 aa  1041    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  57.92 
 
 
545 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  54.13 
 
 
518 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 
550 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
540 aa  273  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 
517 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
507 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
859 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 
447 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  37.24 
 
 
861 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
415 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  29.41 
 
 
484 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
401 aa  97.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  25.32 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  24.37 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.37 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.27 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
366 aa  72  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
522 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  29.03 
 
 
392 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
405 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 
353 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.8 
 
 
403 aa  64.3  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
373 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
388 aa  63.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.87 
 
 
340 aa  63.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
406 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
419 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
439 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.73 
 
 
838 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
430 aa  61.6  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
380 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.95 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  27.67 
 
 
468 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.53 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  22.64 
 
 
405 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
413 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
384 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
386 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
385 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.32 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
379 aa  58.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
416 aa  57.4  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
409 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  22.68 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  27.84 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
382 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
398 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
391 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
414 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
402 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
372 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
372 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
394 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.89 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
415 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
395 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
403 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
420 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
394 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
404 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
836 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 
382 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  21.95 
 
 
369 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
375 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 
391 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  21.95 
 
 
369 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  21.2 
 
 
378 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
374 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
424 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  29.59 
 
 
417 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
370 aa  53.9  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  33.33 
 
 
402 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
385 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>