254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2446 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01956  predicted glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1607  glycosyl transferase group 1  86 
 
 		 407 aa  707    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0834278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1591  putative glycosyl transferase  86 
 
 		 407 aa  709    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 407 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1182  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 407 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2985  putative glycosyl transferase  86.73 
 
 		 407 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2343  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  86.49 
 
 		 407 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  99.75 
 
 		 407 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01945  hypothetical protein  86.49 
 
 		 407 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  84.52 
 
 		 407 aa  718    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  99.26 
 
 		 407 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  99.02 
 
 		 407 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  47.17 
 
 		 420 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  44.17 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  45.21 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  44.84 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  44.23 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  46.33 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  43.38 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  44.12 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  41.81 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  40.77 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  41.89 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  32.11 
 
 		 429 aa  186  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1396  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000038163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  30.58 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1819  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00811272  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 517 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  26.4 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02950  Glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.89718  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 410 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  26.21 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.77 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  28.93 
 
 		 416 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 399 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.29 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.29 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  22.29 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  34.01 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  22.7 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.18 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  24.66 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>