More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4756 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4756  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
385 aa  803    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493707  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
391 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3023  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.51 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.87 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  25.99 
 
 
443 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  24.01 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.52 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  26.19 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  27.34 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  23.23 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  25.83 
 
 
434 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  22.95 
 
 
420 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  25.6 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  23.9 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  25.14 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  21.33 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  23.21 
 
 
426 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  24.7 
 
 
386 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.99 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.59 
 
 
351 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.42 
 
 
417 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  21.35 
 
 
458 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  23.88 
 
 
367 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.8 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
379 aa  59.7  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
422 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
418 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  21.21 
 
 
480 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  23.9 
 
 
431 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  22.83 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
517 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  22.17 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  21.6 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  21.92 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.37 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
458 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
810 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.2 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
363 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  21.61 
 
 
416 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
435 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
384 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.89 
 
 
435 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
440 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
390 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  22.37 
 
 
398 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  23.06 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  21.39 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
448 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  20.32 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
398 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
420 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.17 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1230  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  20.95 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>