44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3023 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3023  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  799    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4756  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493707  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
930 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  24.69 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.3 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
422 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
410 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.93 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.93 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  26.49 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0297  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  20.55 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
358 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 
385 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.09 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.09 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
368 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  22.09 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  22.09 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  22.09 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.09 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
378 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>