More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0229 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
476 aa  931    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 
364 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
365 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  41.62 
 
 
362 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
369 aa  183  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  43.21 
 
 
374 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 
383 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  36.65 
 
 
366 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
370 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  31.76 
 
 
382 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
373 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  36.64 
 
 
803 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
381 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
803 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
871 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
827 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
376 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
816 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.9 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.13 
 
 
377 aa  77  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  32.78 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
812 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
819 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  42.55 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.05 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  35.44 
 
 
816 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
385 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.8 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.65 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  43.93 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.22 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  34.19 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  34.19 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.86 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  37.82 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  37.04 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  24.54 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  32 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.23 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.29 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.59 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  34.51 
 
 
679 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.34 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  39.39 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.61 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>