More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5959 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
364 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  83.7 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  52.78 
 
 
365 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  55.62 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  39.16 
 
 
476 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  46.23 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  45.81 
 
 
374 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 
369 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
370 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  32.61 
 
 
382 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 
421 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.8 
 
 
383 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  42.52 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.69 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  28.57 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  32.28 
 
 
803 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  28.57 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.83 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  29.38 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  35.25 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
803 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
820 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
871 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.78 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  36.22 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  28.57 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.56 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  18.87 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  21.7 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
658 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  37.78 
 
 
638 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
819 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.25 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  32.14 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  33.08 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30.15 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30.15 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30.15 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  42.22 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
381 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  31.75 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  33.08 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.68 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
414 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>