More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0956 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
347 aa  696    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  55.59 
 
 
347 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  51.15 
 
 
347 aa  344  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  46.09 
 
 
346 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  41.19 
 
 
354 aa  269  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  41.46 
 
 
359 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  40.9 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  40.62 
 
 
359 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  39.89 
 
 
358 aa  249  5e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.71 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  37.75 
 
 
358 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  41.01 
 
 
350 aa  222  8e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
396 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
386 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
361 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
419 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.92 
 
 
366 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.92 
 
 
366 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
364 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
355 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
363 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  29.53 
 
 
353 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.21 
 
 
375 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  27.19 
 
 
440 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
388 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
353 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  25.31 
 
 
385 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.52 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
424 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  28.24 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  28.24 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.94 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
351 aa  89.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.2 
 
 
365 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  31.4 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.61 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  28.98 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  25.08 
 
 
428 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 
373 aa  87  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.91 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.59 
 
 
366 aa  85.9  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
414 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.44 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.31 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.38 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
411 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
386 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  26.52 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  21.98 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  26.17 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  32.66 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  25.16 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  26.51 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
425 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>