More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4448 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 428 aa  860    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  72.22 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  57.63 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4880  glycosyl transferase group 1  44.85 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1419  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.05 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.19 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 		 382 aa  96.3  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  25 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.46 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  34.18 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.84 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.42 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.21 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.21 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.21 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  33.93 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  72.22 
 
 		 825 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1266  hypothetical protein  68.97 
 
 		 1382 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.51 
 
 		 935 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  30.92 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4476  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.15 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 871 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  38.89 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  37.09 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2899  group 1 glycosyl transferase  22.98 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00186189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 536 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 		 890 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>