30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0410 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 825 aa  1630    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  73.95 
 
 		 753 aa  1035    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 677 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1266  hypothetical protein  55.34 
 
 		 1382 aa  95.5  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  41.43 
 
 		 704 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  37.76 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  72.22 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3709  glycosyl transferase family 39  32.19 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 658 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 682 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  41.38 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  34.41 
 
 		 996 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  35.71 
 
 		 610 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  34.69 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  31.4 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  41.46 
 
 		 512 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 681 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  80 
 
 		 679 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1591  hypothetical protein  41.94 
 
 		 237 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00589493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  31.19 
 
 		 873 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  35.24 
 
 		 707 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2055  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 729 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.265911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  36.59 
 
 		 717 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  28.26 
 
 		 2679 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  38.14 
 
 		 701 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0515  hypothetical protein  35.62 
 
 		 871 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1043 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 2596 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>