16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1439 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  73.74 
 
 		 602 aa  823    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1205    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3837  hypothetical protein  34.65 
 
 		 573 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 825 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5885  hypothetical protein  23.98 
 
 		 702 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.99906  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  33.71 
 
 		 704 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  26.73 
 
 		 727 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 682 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  28.21 
 
 		 998 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.17 
 
 		 618 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 681 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 729 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 658 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  31.33 
 
 		 726 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>