82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2507 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  100 
 
 		 618 aa  1216    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  72.92 
 
 		 727 aa  806    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  29.97 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 726 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  38.01 
 
 		 536 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  27.57 
 
 		 729 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.15 
 
 		 531 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 510 aa  98.2  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  24.03 
 
 		 658 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  40.68 
 
 		 531 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  37.87 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  37.87 
 
 		 516 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  37.87 
 
 		 516 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  37.87 
 
 		 516 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  37.87 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  36.81 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 		 513 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  24.42 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  34.09 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.68 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  35.43 
 
 		 593 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  32.87 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  34.46 
 
 		 616 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  34.48 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  27.03 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  26.32 
 
 		 526 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  26.51 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 753 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  31.9 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 825 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  29.07 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  25.83 
 
 		 533 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  24.16 
 
 		 533 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.37 
 
 		 492 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  34.01 
 
 		 638 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  24.84 
 
 		 563 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  21.67 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  28.93 
 
 		 605 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  30.34 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  25.33 
 
 		 565 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  30.97 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2370  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  35.16 
 
 		 491 aa  53.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  36.84 
 
 		 517 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1043 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  27.82 
 
 		 592 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  25.71 
 
 		 558 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  21.18 
 
 		 557 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  27.82 
 
 		 592 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 553 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  30 
 
 		 717 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  29.61 
 
 		 526 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  35.77 
 
 		 526 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  26.08 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  29.3 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  28.18 
 
 		 610 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  29.08 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  34.25 
 
 		 494 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  27.78 
 
 		 996 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.04 
 
 		 575 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  26.28 
 
 		 998 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  28.48 
 
 		 556 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  28.22 
 
 		 546 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  28.22 
 
 		 546 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  27.86 
 
 		 486 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  27.84 
 
 		 509 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  27.92 
 
 		 538 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  25.82 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2637  hypothetical protein  23.34 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  28.2 
 
 		 446 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  38.1 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  35.14 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  29.41 
 
 		 547 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  32 
 
 		 707 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  25.27 
 
 		 528 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  28.77 
 
 		 512 aa  43.9  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>