24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0394 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 682 aa  1355    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  69.91 
 
 		 681 aa  851    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  38.7 
 
 		 717 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0334  glycosyltransferase  37.72 
 
 		 646 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184181  normal  0.020995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 677 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  38.17 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 825 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  36.69 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  32.17 
 
 		 727 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  32.18 
 
 		 704 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  32.74 
 
 		 996 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  29.09 
 
 		 602 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  26.83 
 
 		 998 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  25.21 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 726 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  29.91 
 
 		 610 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  31.9 
 
 		 658 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2454  hypothetical protein  25.26 
 
 		 600 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3837  hypothetical protein  29.41 
 
 		 573 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  24.88 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1043 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0594  hypothetical protein  27.36 
 
 		 464 aa  43.9  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>