19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1784 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 998 aa  1970    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  41.21 
 
 		 996 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1043 aa  285  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  31.23 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  42.53 
 
 		 753 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  36.44 
 
 		 704 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 825 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  37.62 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 682 aa  55.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  27.32 
 
 		 929 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  27.86 
 
 		 729 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 681 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  28.21 
 
 		 610 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  32.14 
 
 		 602 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2543  hypothetical protein  36.27 
 
 		 138 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.299266  normal  0.0921107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  26.28 
 
 		 618 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  29.6 
 
 		 727 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  32.14 
 
 		 658 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>