44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2957 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  72.84 
 
 		 726 aa  1029    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  100 
 
 		 729 aa  1444    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  42.11 
 
 		 704 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  34.46 
 
 		 658 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  26.91 
 
 		 618 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  28.27 
 
 		 531 aa  84  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  35.57 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 825 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  35.66 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  34.19 
 
 		 996 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.45 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  24.28 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  29.35 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  25.64 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30.11 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  31.52 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  25.4 
 
 		 592 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 677 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  27.86 
 
 		 998 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  26.21 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  34.07 
 
 		 602 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  32.97 
 
 		 610 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  26.79 
 
 		 516 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  26.79 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  26.79 
 
 		 516 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  28.51 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  24.09 
 
 		 528 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  28.67 
 
 		 873 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 486 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  26.79 
 
 		 516 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  26.79 
 
 		 516 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  23.64 
 
 		 528 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  28.57 
 
 		 547 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  28.78 
 
 		 588 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 494 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  26.82 
 
 		 533 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  28.44 
 
 		 479 aa  44.3  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>