25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11651 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  100 
 
 
565 aa  1126    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  38.56 
 
 
526 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  33.46 
 
 
526 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  34.96 
 
 
504 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  29.54 
 
 
567 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  28.92 
 
 
506 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  29.25 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  28.24 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  30.22 
 
 
523 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  28.12 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  35.09 
 
 
508 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  34.25 
 
 
658 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  24.47 
 
 
618 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  30 
 
 
729 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  28.93 
 
 
478 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  23.38 
 
 
536 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  21.94 
 
 
516 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  32.12 
 
 
726 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  21.94 
 
 
516 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  21.94 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  34.86 
 
 
544 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  21.72 
 
 
516 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  19.62 
 
 
531 aa  47  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30.46 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  21.51 
 
 
516 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>