26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5173 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  100 
 
 
486 aa  954    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  37.52 
 
 
494 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  36.34 
 
 
508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  34.35 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  30.89 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  28.24 
 
 
565 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  47.22 
 
 
506 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  40.93 
 
 
567 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  29.32 
 
 
526 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  28.66 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  31.91 
 
 
658 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  28.54 
 
 
523 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  30.55 
 
 
478 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  25.96 
 
 
531 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  24.06 
 
 
618 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  27.22 
 
 
704 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  20.14 
 
 
507 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  25.45 
 
 
618 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  31.08 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  31.09 
 
 
536 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  36.51 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  21.95 
 
 
531 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  27.97 
 
 
492 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1269  hypothetical protein  29.49 
 
 
573 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
513 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>