21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4105 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  100 
 
 		 526 aa  1040    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  33.79 
 
 		 565 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  32.56 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  34.24 
 
 		 504 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  29.55 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  30.6 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  26.04 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  27.62 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  29.22 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  30.28 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  25.19 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  25.75 
 
 		 726 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  31.67 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  36.14 
 
 		 494 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  26.68 
 
 		 618 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.89 
 
 		 729 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  29.19 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  26.8 
 
 		 536 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>