54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0233 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  100 
 
 		 529 aa  1046    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.05 
 
 		 536 aa  123  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  28.21 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  28.21 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  28.21 
 
 		 516 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  28.21 
 
 		 516 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  27.95 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  24.88 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.47 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.99 
 
 		 507 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  24.82 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  28.89 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  31.64 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  28.27 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 729 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  28.1 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  30.29 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  29.88 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  26.94 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  26.19 
 
 		 726 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  28.71 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  30.88 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  25.65 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.94 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  24.23 
 
 		 704 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  25.4 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.72 
 
 		 531 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  25.26 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  31.29 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  31.93 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  30.49 
 
 		 588 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  31.29 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  33.82 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.32 
 
 		 605 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 658 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  23.65 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  24.48 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  29.09 
 
 		 593 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  25.11 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  25.14 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  25.11 
 
 		 592 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 513 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  25.7 
 
 		 526 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  25.78 
 
 		 544 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  23.65 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  25.79 
 
 		 727 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  32.04 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  27.23 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  26.26 
 
 		 506 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  29.23 
 
 		 523 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  29.81 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  24.67 
 
 		 563 aa  43.5  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>