27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2971 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  100 
 
 		 544 aa  1043    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.59 
 
 		 536 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30.02 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  29.15 
 
 		 726 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 529 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  34.11 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  33.57 
 
 		 729 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  25.51 
 
 		 658 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  29.34 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  33.91 
 
 		 704 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  34.09 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.08 
 
 		 507 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  24.42 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.56 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  33.59 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  33.59 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  33.59 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  23.53 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  32.62 
 
 		 479 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  35.09 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  30.19 
 
 		 557 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  33.86 
 
 		 605 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  30.41 
 
 		 727 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.93 
 
 		 618 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>