26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0213 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  940    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  63.3 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  53.31 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  28.12 
 
 		 506 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.87 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  24.81 
 
 		 516 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  24.81 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  26.34 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  24.81 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  32 
 
 		 616 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  28.78 
 
 		 704 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  23.58 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  33.61 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  27.87 
 
 		 593 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1269  hypothetical protein  28.28 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  35.62 
 
 		 526 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  22.39 
 
 		 507 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  27.89 
 
 		 588 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  26.9 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 529 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  25.91 
 
 		 546 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22231  hypothetical protein  39.62 
 
 		 59 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  29.28 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  27.5 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>