22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25171 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1020    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  30.83 
 
 
509 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  28.27 
 
 
479 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  36.09 
 
 
474 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  25.81 
 
 
536 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  27.92 
 
 
531 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  25.3 
 
 
618 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
513 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  31.08 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  27.42 
 
 
516 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  27.42 
 
 
516 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  27.42 
 
 
516 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  39.08 
 
 
546 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  27.42 
 
 
516 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  27.42 
 
 
516 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  27.5 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  28.11 
 
 
526 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  28.82 
 
 
533 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  30.86 
 
 
532 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  28.24 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  27.63 
 
 
558 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.46 
 
 
531 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>