66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1520 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  98.84 
 
 
516 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  99.03 
 
 
516 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  97.48 
 
 
516 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  100 
 
 
516 aa  1058    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  97.67 
 
 
516 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  37.74 
 
 
531 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  25.66 
 
 
536 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  40.26 
 
 
618 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  28.21 
 
 
529 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  27.46 
 
 
534 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.37 
 
 
507 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  35.59 
 
 
727 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  31.12 
 
 
531 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  37.21 
 
 
544 aa  84  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  31.34 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  34.07 
 
 
588 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  32.98 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  36.67 
 
 
616 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  33.15 
 
 
533 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  33.15 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  33.58 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  28.02 
 
 
528 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.09 
 
 
510 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  26.06 
 
 
546 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  27.18 
 
 
528 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  26.79 
 
 
558 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  30.23 
 
 
618 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  33.64 
 
 
638 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  34.22 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1177  beta-lactamase domain-containing protein  65.12 
 
 
98 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  27.95 
 
 
492 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  29.48 
 
 
535 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  34.65 
 
 
564 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  30.72 
 
 
557 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  30.69 
 
 
509 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  37.58 
 
 
526 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  33.66 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  35.11 
 
 
558 aa  53.9  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.42 
 
 
506 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  31.18 
 
 
547 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  21.94 
 
 
565 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  30.99 
 
 
569 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  28.57 
 
 
592 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  30.08 
 
 
658 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 
592 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  33.33 
 
 
592 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  24.77 
 
 
546 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  24.77 
 
 
546 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  35.06 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  35.06 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  26.6 
 
 
726 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  25.73 
 
 
605 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  30.51 
 
 
474 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  26.29 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  26.29 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1555  membrane protein-like protein  31.17 
 
 
363 aa  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.914032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2778  hypothetical protein  26.92 
 
 
513 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  39.22 
 
 
506 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  28.47 
 
 
607 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  29.93 
 
 
729 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  32 
 
 
563 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4370  hypothetical protein  30.18 
 
 
527 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000787252  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  25.71 
 
 
550 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  27.92 
 
 
494 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  28.93 
 
 
704 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>