35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4086 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  922    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  81.17 
 
 		 508 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  37.52 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  35.97 
 
 		 446 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  37.65 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  36.84 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  39.66 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  29.48 
 
 		 565 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  33.47 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  32.27 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  28.29 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  27.38 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  27.38 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  27.38 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  27.08 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  27.08 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.35 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  31.94 
 
 		 616 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  29.19 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  27.48 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.84 
 
 		 536 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  20.06 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.4 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  35.25 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.75 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0769  hypothetical protein  36.67 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0333554  hitchhiker  0.00590563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 513 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  27.27 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  24.88 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  29.11 
 
 		 727 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>